Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chchd1Q9CQA6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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