Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med4Q9CQA5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med4Q9CQA5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms