Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms