Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gdpd3Q99LY2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms