Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ciao1Q99KN2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ciao1Q99KN2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms