Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab28Q99KL7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab28Q99KL7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab28Q99KL7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab28Q99KL7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab28Q99KL7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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