Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apobec3Q99J72 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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