Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smim11aQ99J19 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smim11aQ99J19 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Smim11aQ99J19 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim11aQ99J19 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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