Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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