Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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