Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms