Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim29Q8R2Q0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms