Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms