Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp27Q8K194 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms