Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms