Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RybpQ8CCI5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms