Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcaphQ8C156 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms