Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cnpy4Q8BQ47 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms