Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc17a8Q8BFU8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc17a8Q8BFU8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms