Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NischQ80TM9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NischQ80TM9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NischQ80TM9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NischQ80TM9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NischQ80TM9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NischQ80TM9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NischQ80TM9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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