Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aebp1Q640N1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms