Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col4a5Q63ZW6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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