Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms