Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Klf3Q60980 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms