Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms