Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms