Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms