Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf48Q3US17 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf48Q3US17 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms