Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
E130208F15RikQ3UPV3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms