Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms