Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp19Q3UJD6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms