Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm648Q3UJ22 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms