Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms