Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trim71Q1PSW8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trim71Q1PSW8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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