Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmprss11cQ1JRP2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmprss11cQ1JRP2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmprss11cQ1JRP2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Tmprss11cQ1JRP2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmprss11cQ1JRP2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmprss11cQ1JRP2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Tmprss11cQ1JRP2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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