Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms