Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms