Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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Sh3bp2Q06649 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sh3bp2Q06649 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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