Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GscQ02591 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
GscQ02591 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
GscQ02591 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms