Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SeleQ00690 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms