Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms