Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms