Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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