Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1151.9 ms