Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lmo4P61969 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Lmo4P61969 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Lmo4P61969 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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