Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms