Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp25P57080 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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