Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmoP56726 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SmoP56726 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SmoP56726 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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