Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TdgP56581 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TdgP56581 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TdgP56581 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TdgP56581 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms