Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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